Karyomapping技术在单基因PGD中的应用
单基因遗传病是因单一基因突变而引发的一类遗传疾病,表现形式包括核苷酸的替换、基因内部片段的插入、缺失及重复等。按照遗传方式的不同,这类疾病可归类为常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传、X连锁显性遗传、X连锁隐性遗传、Y连锁遗传以及线粒体遗传。据估算,人类已知的单基因遗传病种类超过一万种。单基因遗传病通常具有先天性和终身性的特点,由于大多数此类疾病无法实现根治,患病个体在健康和经济方面常会对家庭和社会构成重大负担。通过SGD-PGD技术,可以在胚胎阶段筛选不携带致病基因的胚胎,从而从根本上阻断单基因遗传病的传递,避免后代罹患相关疾病。在辅助生殖领域,单基因遗传病相关研究一直是热点。然而,受技术限制,目前的SGD-PGD方法一般针对特定单基因遗传病而定制检测方案。由于胚胎细胞样本来源有限、扩增困难且对操作人员技术要求较高,现有方法多集中于几十种高发病率疾病,对于其他较为罕见的单基因遗传病还缺乏完善的检测手段。因此,开发一种通用、易操作且适用性广泛的SGD-PGD方案显得尤为重要。

Karyomapping技术由美国Illumina公司的生殖与遗传学领域首席科学家Alan Handyside教授发明,该技术通过结合Illumina公司的专利BeadArray平台和特有分析方法,在单一检测平台上实现对几乎所有单基因遗传病的筛查。
Karyomapping技术的工作原理基于连锁分析,可用于胚胎期单基因遗传病的检测,适合于存在严重遗传病史的夫妇或曾生育过遗传病患儿的家庭。当前的SGD-PGD技术主要依赖目标基因附近的短串联重复序列(short tandem repeats, STR)的检测。每种遗传病的STR检测都需针对夫妻双方及具体疾病专门设计,并由熟练技术人员进行实验操作,而这一过程通常耗时数周或数月。基于STR检测的复杂性导致其成本高昂且限制广泛应用,仅少数实验室可提供此类服务。Karyomapping技术通过连锁分析,利用父母及一名该单基因遗传病状态已知的近亲(如患病子代)为参考,在全基因组范围内分析相关SNP位点信息,进而识别与致病基因相关的区域。
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